MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	TCAT	2	8	272	279	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
2	NC_015665	TTAT	2	8	309	316	25 %	75 %	0 %	0 %	336233475
3	NC_015665	TGA	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
4	NC_015665	ATCT	2	8	350	357	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
5	NC_015665	ATC	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233475
6	NC_015665	TAATT	2	10	398	407	40 %	60 %	0 %	0 %	336233475
7	NC_015665	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233475
8	NC_015665	TTC	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233475
9	NC_015665	CATA	2	8	559	566	50 %	25 %	0 %	25 %	336233475
10	NC_015665	TTGTT	2	10	582	591	0 %	80 %	20 %	0 %	336233475
11	NC_015665	TGAT	2	8	623	630	25 %	50 %	25 %	0 %	336233475
12	NC_015665	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
13	NC_015665	ATG	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
14	NC_015665	GA	3	6	745	750	50 %	0 %	50 %	0 %	336233475
15	NC_015665	TTA	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233475
16	NC_015665	TCAT	2	8	832	839	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
17	NC_015665	TGT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233476
18	NC_015665	ATGAA	2	10	2076	2085	60 %	20 %	20 %	0 %	336233476
19	NC_015665	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
20	NC_015665	GCTG	2	8	2187	2194	0 %	25 %	50 %	25 %	336233476
21	NC_015665	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	336233476
22	NC_015665	AAG	2	6	2258	2263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233476
23	NC_015665	AGAA	2	8	2303	2310	75 %	0 %	25 %	0 %	336233476
24	NC_015665	A	6	6	2309	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	336233476
25	NC_015665	GGC	2	6	2315	2320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
26	NC_015665	GC	3	6	2409	2414	0 %	0 %	50 %	50 %	336233476
27	NC_015665	TAT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233476
28	NC_015665	ATA	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233476
29	NC_015665	GTG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233476
30	NC_015665	AAC	2	6	2526	2531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
31	NC_015665	T	6	6	2704	2709	0 %	100 %	0 %	0 %	336233477
32	NC_015665	CTT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233477
33	NC_015665	ACA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
34	NC_015665	CAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
35	NC_015665	ATGG	2	8	3219	3226	25 %	25 %	50 %	0 %	336233477
36	NC_015665	TGA	3	9	3227	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
37	NC_015665	CAA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
38	NC_015665	GTA	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
39	NC_015665	GA	3	6	3606	3611	50 %	0 %	50 %	0 %	336233478
40	NC_015665	GAT	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
41	NC_015665	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
42	NC_015665	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233478
43	NC_015665	ATG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
44	NC_015665	ATA	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233478
45	NC_015665	TCA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233478
46	NC_015665	TTGA	2	8	3868	3875	25 %	50 %	25 %	0 %	336233478
47	NC_015665	GGC	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233478
48	NC_015665	T	6	6	3964	3969	0 %	100 %	0 %	0 %	336233478
49	NC_015665	AGA	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233478
50	NC_015665	TAG	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
51	NC_015665	TC	3	6	4177	4182	0 %	50 %	0 %	50 %	336233478
52	NC_015665	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233478
53	NC_015665	ATGG	2	8	4243	4250	25 %	25 %	50 %	0 %	336233478
54	NC_015665	ATG	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
55	NC_015665	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
56	NC_015665	T	6	6	4851	4856	0 %	100 %	0 %	0 %	336233479
57	NC_015665	TCGT	2	8	4917	4924	0 %	50 %	25 %	25 %	336233479
58	NC_015665	AGG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233479
59	NC_015665	TCC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
60	NC_015665	T	6	6	5137	5142	0 %	100 %	0 %	0 %	336233479
61	NC_015665	GAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233479
62	NC_015665	CATA	2	8	5309	5316	50 %	25 %	0 %	25 %	336233479
63	NC_015665	TCC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
64	NC_015665	CTT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
65	NC_015665	CTT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
66	NC_015665	CTTC	2	8	5499	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	336233479
67	NC_015665	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233479
68	NC_015665	TGA	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
69	NC_015665	TCC	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
70	NC_015665	AGCC	2	8	5630	5637	25 %	0 %	25 %	50 %	336233479
71	NC_015665	TAG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
72	NC_015665	TTC	2	6	5806	5811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
73	NC_015665	CTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
74	NC_015665	TAGG	2	8	5907	5914	25 %	25 %	50 %	0 %	336233479
75	NC_015665	CAA	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
76	NC_015665	GCG	2	6	6207	6212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233480
77	NC_015665	CTT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
78	NC_015665	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
79	NC_015665	AAG	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233480
80	NC_015665	ATT	2	6	6460	6465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233480
81	NC_015665	CGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
82	NC_015665	TCAT	2	8	6541	6548	25 %	50 %	0 %	25 %	336233480
83	NC_015665	AGCA	2	8	6602	6609	50 %	0 %	25 %	25 %	336233480
84	NC_015665	TGT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
85	NC_015665	GTTTT	2	10	6657	6666	0 %	80 %	20 %	0 %	336233480
86	NC_015665	AAC	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
87	NC_015665	A	6	6	6832	6837	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
88	NC_015665	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
89	NC_015665	AAGCAA	2	12	6916	6927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233480
90	NC_015665	CGC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233480
91	NC_015665	GCA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
92	NC_015665	TAAC	2	8	6997	7004	50 %	25 %	0 %	25 %	336233480
93	NC_015665	CAG	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
94	NC_015665	TC	3	6	7147	7152	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
95	NC_015665	TCT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
96	NC_015665	GCGG	2	8	7304	7311	0 %	0 %	75 %	25 %	336233480
97	NC_015665	TGA	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
98	NC_015665	CAC	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233480
99	NC_015665	GAAA	2	8	7376	7383	75 %	0 %	25 %	0 %	336233480
100	NC_015665	A	6	6	7381	7386	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
101	NC_015665	AACGA	2	10	7389	7398	60 %	0 %	20 %	20 %	336233480
102	NC_015665	CGCC	2	8	7415	7422	0 %	0 %	25 %	75 %	336233480
103	NC_015665	TTC	2	6	7468	7473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
104	NC_015665	GAA	2	6	7503	7508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233480
105	NC_015665	A	6	6	7587	7592	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
106	NC_015665	CAT	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233480
107	NC_015665	A	6	6	7625	7630	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
108	NC_015665	TGGG	2	8	7749	7756	0 %	25 %	75 %	0 %	336233480
109	NC_015665	CTG	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233480
110	NC_015665	CAG	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
111	NC_015665	ATTT	2	8	7824	7831	25 %	75 %	0 %	0 %	336233480
112	NC_015665	GCT	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233480
113	NC_015665	GCA	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
114	NC_015665	ATTGTC	2	12	7974	7985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336233480
115	NC_015665	G	6	6	8064	8069	0 %	0 %	100 %	0 %	336233480
116	NC_015665	GATT	2	8	8138	8145	25 %	50 %	25 %	0 %	336233480
117	NC_015665	CGG	2	6	8162	8167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233480
118	NC_015665	TG	3	6	8171	8176	0 %	50 %	50 %	0 %	336233480
119	NC_015665	ATG	2	6	8208	8213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
120	NC_015665	CT	3	6	8227	8232	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
121	NC_015665	GCGAAA	2	12	8286	8297	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336233480
122	NC_015665	A	7	7	8295	8301	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
123	NC_015665	A	6	6	9444	9449	100 %	0 %	0 %	0 %	336233481
124	NC_015665	ATT	2	6	9525	9530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233481
125	NC_015665	TTGG	2	8	9635	9642	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
126	NC_015665	AAG	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
127	NC_015665	GT	3	6	9670	9675	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
128	NC_015665	A	8	8	9683	9690	100 %	0 %	0 %	0 %	336233481
129	NC_015665	AT	3	6	9692	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
130	NC_015665	CTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233481
131	NC_015665	GTC	2	6	9759	9764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233481
132	NC_015665	CGGC	2	8	9781	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	336233481
133	NC_015665	AAG	2	6	9835	9840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
134	NC_015665	A	6	6	9877	9882	100 %	0 %	0 %	0 %	336233481
135	NC_015665	GAA	2	6	9885	9890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
136	NC_015665	GAA	2	6	9912	9917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
137	NC_015665	AAG	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
138	NC_015665	A	7	7	9964	9970	100 %	0 %	0 %	0 %	336233481
139	NC_015665	CAT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233481
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154	NC_015665	AGG	2	6	10379	10384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233481
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258	NC_015665	TTC	2	6	20451	20456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233488
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260	NC_015665	TCT	2	6	20521	20526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233488
261	NC_015665	CAA	2	6	20531	20536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233488
262	NC_015665	CGA	2	6	20580	20585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233488
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266	NC_015665	AAAT	2	8	20750	20757	75 %	25 %	0 %	0 %	336233488
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396	NC_015665	TCC	2	6	27273	27278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233493
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399	NC_015665	GA	3	6	27455	27460	50 %	0 %	50 %	0 %	336233493
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403	NC_015665	TTC	2	6	27549	27554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233493
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434	NC_015665	TCA	2	6	29178	29183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233495
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437	NC_015665	CTT	2	6	29305	29310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233495
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498	NC_015665	T	6	6	36949	36954	0 %	100 %	0 %	0 %	336233502
499	NC_015665	GGAC	2	8	37050	37057	25 %	0 %	50 %	25 %	336233502
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